总的来说这两种药物都属于核苷类似物，恩替卡韦的研发时间没有阿德福韦长。参加恩替卡韦临床研究的病例没有阿德福韦多。阿德福韦可以拿出连续治疗四年的结果，而恩替卡韦目前公开发表的仅有一年的数据，长期疗效和安全性有待进一步观察，因为两个药都面临长期治疗的问题。
这两个药物的表现各有所长，到底谁好谁不好，要进行综合评价。大家都看过体操表演，如果总的看两个药物，就跟体操表演全能体操的话，有单杠、双杠、自由体操等等。抗病毒治疗的疗效就看几方面的表现，HBV-DNA阴转的比例、ALT的复常、肝脏组织学的改善、HBeAg血清转换等。恩替卡韦HBV-DNA阴转的速度比阿德福韦快，但有一个综合的表现，就是e抗原血清转化率，两个药是差不多的。
还有一个特点，打个比方，体操运动员表演不仅难度要高，而且要发挥稳定。对于药物来说，就是耐药性的问题。根据现有资料，如果患者以前没有用过核苷类药物的话，这两个药物耐药发生率是差不多，第一年的治疗都是0，而对于已经对拉米夫定出现耐药的患者，阿德福韦治疗疗效不受影响，阿德福韦对所有患者都是敏感的，而根据恩替卡韦临床研究结果，拉米夫定耐药患者接受恩替卡韦的剂量要比初治患者的剂量高一倍，治疗一年后，由大概1～2%的患者出现临床耐药，很少见，但确实有交叉耐药。而继续治两年、三年，对于这些已经对拉米夫定耐药的患者，恩替卡韦的耐药发生率还会进一步升高。
目前现在没有办法完全、充分地评价这两个药。因为这两个药在参加临床研究的病例数、临床研究的长短都不一样，现在只是有一些初步的比较结果。如果三年、四年以后，恩替卡韦有了三年、四年的资料，就可以和阿德福韦做比较了，到那个时候再作比较就更准确。
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