以前人们普遍认为HBeAg是病毒活跃复制的标志，抗-HBe阳转表示HBV复制减少或基本停止。但根据多年临床的观察和研究，血清HBeAg阴性而抗-HBe阳性患者含有高滴度的HBV-DNA，提示HBV复制活跃，原因，就是病毒前C区基因发生突变，无法正确的表达HbeAg，HbeAg呈阴性。所以前C变异的主要特征，是小三阳、DNA阳性。前C变异的发生一般是在免疫压力下自然发生，以逃避免疫的打击，所以发生前C变异后，病毒相对更难清除，而且药物的应用范围也相对局限。
一般认为，干扰素对前C变异的患者，效果不好，停药易复发。而拉米夫定和其他核苷类药物对前C变异的效果较好。另外阿德福韦等正在临床试验的药物已经被证明对前C变异有效，这些药物的上市，将缓解一些患者的需求。
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